文章摘要
【关 键 词】 生物数据、抗衰老、蛋白质工程、人工智能、细胞再生
OpenAI与Retro Biosciences合作,推出了新模型GPT-4b micro,这是OpenAI首个专注于生物数据的大模型,旨在通过改进蛋白质因子功能来延长人类寿命。Retro Biosciences是一家致力于抵抗细胞衰老新药开发的创业公司,其联合创始人丁胜教授团队曾在2022年成功诱导小鼠全能干细胞并稳定培养,成果登上Nature。另一位联合创始人Joe Betts-LaCroix在加州理工期间的研究成果也曾登上Science,并在YC担任过2.5年的兼职合伙人。
Retro Biosciences的目标是将人类正常寿命延长10年,与OpenAI合作的重点是研究山中因子,这是一组由诺奖得主山中伸弥提出的蛋白质,可以将人类皮肤细胞转化为更年轻的干细胞。然而,这种细胞“重编程”效率不高,需要数周时间,且不到1%的细胞能完成再生。为此,OpenAI开发了GPT-4b micro模型,用大量物种的蛋白质序列实例以及蛋白质相互作用相关信息进行训练,提出改进蛋白质因子功能的方法。
GPT-4b micro的工作方式与谷歌的AlphaFold不同,后者用于预测蛋白质结构,而山中因子是一类无固定结构的蛋白质。Retro的科学家使用“few-shot”提示引导模型生成可能的山中蛋白质重新设计方案。尽管基因工程师在实验室中可以引导分子进化,但受限于实验条件,他们通常只能测试有限的可能性,而OpenAI的模型能生成含显著改动的设计建议,其中三分之一的蛋白质氨基酸被改变。
Retro CEO Joe Betts-Lacroix表示,模型提出的建议很好,立即将模型应用到实验室并得到了实际成果。OpenAI介绍,研究人员根据模型的建议对两个山中因子进行了改造,初步测量结果显示效果提升了50倍以上。然而,在研究结果发表之前,外界科学家无法验证这些结果的真实性,且该模型目前未对外开放使用,只有一个定制化的展示案例。关于模型的未来走向,是否单独发布或整合到OpenAI主流推理模型中,尚未确定。OpenAI还特别强调,公司CEO奥特曼并未直接参与这项工作,且公司从未根据奥特曼的其他投资作出决策。
原文和模型
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【原文作者】 量子位
【摘要模型】 moonshot-v1-32k
【摘要评分】 ★☆☆☆☆