首个国产版AlphaFold3发布！大分子预测精度超车，在线平台即开即用，推理成本更是白菜价

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文章摘要

【关键词】 HelixFold3、生物计算、结构预测、云服务平台、生命科学

百度智能云与百度螺旋桨团队联合推出了国内首个对标AlphaFold3的产品——HelixFold3。这一产品在常规生物分子结构预测任务中达到了与AlphaFold3相媲美的水平，特别是在RNA分子和共价修饰场景中，精准度上实现了持平或大幅超越。在抗原-抗体结构预测任务中，HelixFold3的成功率提升至80%以上，显示出其在研究抗体结合机制方面的潜力。

HelixFold3的在线服务平台即开即用，用户只需简单开通，按算力付费，全程零代码操作，无需担心后续运维。推理速度快，能在数小时内完成数千次分子结构预测。此外，HelixFold3支持大分子的任意侧链修饰，输入分子实体后，旁边有配体结构展示，设置参数约束后，剩下的工作交给HelixFold3完成，最终得到3D结构和相应的参数结果。

HelixFold3通过SMILES定义侧链修饰，覆盖的化学空间更广，覆盖PDB数据库中超过50%的修饰场景，而AlphaFold3仅支持不到5%，相当于修饰场景扩大了十倍。这大幅度扩展了生命科学从业者的研究空间，覆盖了小蛋白/多肽发现、酶改造等具体应用。

借助百度智能云CHPC平台，HelixFold3在MSA检索与模型推理方面的性能优化，大幅降低了推理成本，提高了从业者的研究速率。在百度云平台上，一条500长度的蛋白推理只需要4元钱，相较于云端租用或自行部署GPU的成本，降低了一个指数级别。

HelixFold3的推出，不仅提升了模型的精度和效率，也为行业带来了更多可能性。大模型在生命科学领域，正朝着更深更广的方向探索，加速实现从技术到应用的跨越，迈向新阶段。百度在生命科学领域深耕多年，自主研发了文心生物计算大模型系列，包括化合物通用表征模型HelixGEM和HelixGEM-2、蛋白结构分析模型HelixFold、以及单序列蛋白表征模型HelixFold-Single，为虚拟筛选、ADMET预测、蛋白质结构预测、mRNA序列设计等提供了便携强大的算法工具。百度智能云还构建了一整套完整的生命科学解决方案，覆盖从药物研发到下游诊疗场景的全链条，拓展了大模型在生命科学领域的价值边界。